上が改札前、下がホーム上に設置されている発車標です。JR神戸線の明石以東の普通しか停まらない駅の発車標は改札前が液晶ディスプレイ式、ホーム上のものは2段のLED式のものが採用されている駅が多いですが、摩耶駅の場合は改札前・ホーム上共に3段のLED式のものが採用されています。
改札前のものは種別・列車名/遅れ・発車時刻・乗り場が表示されます。ホーム上のものは種別・発車時刻の他に行き先と乗車位置が交互に表示されるようになっています。列車接近時には最下段が2駅手前からの接近案内が表示されるようになっています。
